Theo qui định tại Thông tư số 03/2013/TT-BTC về Qui định phí thẩm định kinh doanh thương mại có điều kiện, thẩm định tiêu chuẩn, điều kiện hành nghề Y, Dược, lệ phí cấp giấy phép xuất khẩu, nhập khẩu trang thiết bị y tế, dược phẩm, cấp chứng chỉ hành nghề y, cấp giấy phép hoạt động đối với cơ sở khám bệnh,chữa bệnh cụ thể như sau :
+ Thẩm định tiêu chuẩn, điều kiện bảo quản thuốc
( cơ sở đăng ký GSP) : 14.000.000 đồng/ lần thẩm định.
+ Thẩm định tiêu chuẩn và điều kiện kinh doanh thuốc đối với cơ sở bán buôn thuốc(GDP):
. Doanh nghiệp: 4.000.000 đồng/ lần thẩm định;
. Đại lý: 1.000.000 đồng/ lần thẩm định.
+ Thẩm định tiêu chuẩn thực hành tốt nhà thuốc tốt (GPP) hoặc tiêu chuẩn và điều kiện hành nghề dược đối với các cơ sở bán lẻ thuốc chưa bắt buộc thực hiện nguyên tắc, tiêu chuẩn thực hành tốt nhà thuốc theo lộ trình:
. Đối các địa bàn thuộc vùng khó khăn: 500.000 đồng/ lần thẩm định;
. Đối với các khu vực còn lại: 1.000.000 đồng/ lần thẩm định.
+ Thẩm định tiêu chuẩn và điều kiện hành nghề đối với cơ sở kinh doanh thuốc từ dược liệu (bao gồm cả dược liệu), thuốc đông y (bao gồm cả thuốc phiến):
. Đối với tỉnh, thành phố trực thuộc TW; tỉnh đồng bằng trung du: 500.000 đồng/ cơ sở;
. Đối với tỉnh miền núi, vùng sâu, vùng xa: 200.000 đồng/ cơ sở.